Stań się prawdziwym bohaterem

Medic Ninja

Ta organizacja głównie skupia się na leczeniu innych ninja. Posiadają w swoim arsenale techniki medyczne, które są bardzo przydatne, gdy nasz kompan, lub gdy sami zostaliśmy ranni. Zwierzę, które służy ludziom z tej organizacji to Ślimak.
Lider Organizacji: Brak

Hebi

Jest to organizacja, która jest wrogo nastawiona do członków organizacji Kaeru. Ludzie z tej organizacji posiadają potężne techniki, które w większości związane są z wężami. Zwierzę, które służy ludziom z tej organizacji to Wąż.
Lider Organizacji: Brak

Kaeru

Jest to organizacja, która jest wrogo nastawiona do członków organizacji Hebi. Ludzie z tej organizacji posiadają potężne techniki, które w większości związane są z żabami lub ropuchami. Zwierzę, które służy ludziom z tej organizacji to płaz, który jest nam wszystkim znany(Żaba/Ropucha).
Lider Organizacji: Brak

Akatsuki

Jest to organizacja, która ma w sobie najsilniejszych ninja. Nie można się do niej zapisać, ponieważ są w niej postaci fabularne. Głównym celem organizacji jest złapanie wszystkich ogoniastych demonów i wykorzystanie ich do zniszczenia wszystkich 5 wiosek. Kage wiosek są zobowiązani do powstrzymania członków akatsuki, za wszelką cenę. Nie jest to jednak łatwe. Wielu wspaniałych Kage poległo z rąk tych potężnych osobowości, a to wszystko po to by złapać i zapieczętować Jinchuriki.

HAWK

Organizacja ta składa się z 4 członków. Są oni zaprzyjaźnieni z Akatsuki. Każdy z członków, ma inne, unikatowe umiejętności. Dążą oni do zniszczenia wszystkich 5 wiosek, tak samo jak Akatsuki.